硬式野球部が「満額支給」されるのは、顧問が何に対してなら支給してもらえるかが分かっていて、それ以上の申請をしないからだと思います。
練習に必要なマシンやボールがずっとボロボロのままで、お金がないため危なくてもそのまま使っていると聞いたことがあります。毎月の部費に加えて、個人の試合道具費、試合期間の毎週1人1000〜2000円の交通費も払っているそうです。
それらを含めず最低限試合に出られる額の申請にとどめているため「満額支給」になるんだと思います。
大会実績のある自動車部などは、大会に出れるだけの支給はされているということではないんでしょうか。もし大会参加費に対して支給額では足りていないのなら、それは大問題だと思います。
また、このように不満が出るような予算の決め方はやはり改善すべきです。不満を言われる野球部も、申請の通らない理由が分からないクラブも、どちらもかわいそうです。